Учился на вечернем искусствоведческом отделении исторического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова.
1958-1983 гг. - художник-реставратор отдела иконописи Всероссийскоого реставрационноого центра. "Читавший спецкурс по реставрации живописи на искусствоведческом отделении МГУ Виктор Васильевич Филатов, сам не знаю почему, предложил мне, студенту-вечернику, освоить вторую профессию во Всероссийском реставрационном центре. Выслушав возражения, сводившиеся к отсутствию художественного опыта, молодой, прошедший войну и сохранивший на всю жизнь офицерскую выправку учитель заверил меня, что прилежание и любовь к древнерусскому искусству - главные составляющие в деятельности реставратора. "Художественные амбиции иногда даже мешают возрождению подлинных творений старых мастеров"."
С 1983 г. - заведующий отделом и ведущий научный сотрудник ГосНИИреставрации.
Большую часть своей жизни Ямщиков провёл в русской провинции, сначала занимаясь профилактическими реставрационными работами на произведениях иконописи, а затем, обследуя музейные запасники, составляя реставрационную "Опись произведений древнерусской живописи, хранящихся в музеях РСФСР" и отбирая иконы для восстановления в Москве.
Писатель, искусствовед, историк искусства, писатель, публицист, реставратор.
За сорок с лишним лет Ямщикову удалось возродить сотни произведений иконописи, уникальные собрания провинциальных русских портретов XVIII-XIX вв. из различных музеев России, вернуть многие забытые имена замечательных художников. Организованные Ямщиковым выставки, на которых показывались новые открытия реставраторов, стали неотъемлемой частью отечественной культуры. На них воспитывались молодые художники, историки искусства, писатели и все те, кому дорого художественное наследие России.
Кроме реставрационных выставок Ямщиков сумел познакомить современников с сокровищами частных коллекций Москвы и Санкт-Петербурга - от икон до лучших образцов авангардного искусства. Владельцы личных собраний избрали его председателем Клуба коллекционеров Советского фонда культуры. Издав десятки книг, альбомов, каталогов, опубликовав сотни статей и интервью в периодической печати, Ямщиков много лет вёл постоянные рубрики на Центральном телевидении, снимал редкие сюжеты в различных городах России и за рубежом.
Умер 19 июля 2009 г. в г. Пскове. Похоронен в Пушкинских Горах на городище Воронич, на кладбище у храма вмч. Георгия Победоносца.
Дважды женат. Вторая жена - балерина Кировского балета Валентина Ганибалова. Дочь - Марфа.
Заслуженный деятель искусств Российской Федерации
Председатель Ассоциации реставраторов России.
Художник-реставратор высшей категории.
Член Союза писателей России
Член президиума Всероссийского общества охраны памятников истории и культуры
Вице-президент Российского международного Фонда культуры
Ведущий специалист ГосНИИР (Всероссийского института реставрации)
Председатель Клуба коллекционеров Советского фонда культуры
Цитаты Ямщикова:
"Военторг" потерян, гостиница "Москва" потеряна , Манежная площадь потеряна, Стрелка потеряна, Гоголевский бульвар потерян. Все делается. Говорят об экспертах. Хоть раз нас позвали обсудить, ставить там памятник или не ставить, уничтожать памятник или не уничтожать. Потом, говорят, покричат. Только одна архитектура – бумажная, желательно из зеленых денег. Вот что я заявляю официально. Прекратите! Оставьте нам немного той Москвы, в которой мы выросли!"
Награды Русской Православной Церкви:
Орден Святого благоверного князя Даниила Московского
Прочие награды:
Лауреат премии Ленинского комсомола
орден "Полярная Звезда" Республики Якутия (Саха)
Почётная медаль Российской Академии художеств (первый реставратор, получивший за двухсотлетнюю историю Российской Академии художеств её Почётную медаль)
Лауреат звания "Герой "Труда"" за 2007 год (премия газеты "Труд")
Сочинения:
Древнерусская живопись: Новые открытия: альбом / Автор альбома С.Ямщиков, оформление Е.Ганнушкина. М.: Советский художник, 1966. - 48 репродукций. Изд. 2-е. СПб., 1969
Суздаль. Музей. М., 1968.
Сокровища Суздаля: сб.статей / Составитель С.Ямщиков. М.: Изобразительное искусство, 1969
Русский музей. Иконы из собрания Русского музея: буклет / авт.-сост. С.Ямщиков, худ. М.Ромадин. М.: Советская Россия, 1970
Суздаль / Авт.-сост. С.Ямщиков. М.: Планета, 1970
Опись произведений древнерусской живописи, хранящихся в музеях РСФСР: материалы для реставрационного каталога. Ч. I: Псковский историко-художественный музей, Новгородский историко-художественный и архитектурный музей-заповедник, Кировский краеведческий музей, Рязанский краеведческий музей, Рязанский художественный музей. М., 1970
Опись произведений древнерусской живописи, хранящихся в музеях РСФСР: материалы для реставрационного каталога. Ч. II: Ростовский историко-художественный и архитектурный музей-заповедник, Угличский историко-художественный музей, Переславль-Залесский историко-художественный музей, Горьковский художественный музей, Тотемский краеведческий музей, Костромской музей изобразительных искусств, Костромской историко-архитектурный музей-заповедник. М., 1972
Псков. Музей. Древнерусская живопись. М., 1973.
Русский портрет XVIII-XIX веков в музеях РСФСР: Тула, Смоленск, Ясная Поляна, Калинин, Новгород, Переславль-Залесский, Кострома, Ярославль, Горький, Псков: альбом. М.: Изобразительное искусство, 1976
Древний Новгород: История, Искусство, Археология: Новые исследования: сб. статей / Сост. Ямщиков С., худ. Е.Семёнов. М.: Изобразительное искусство, 1983
Древний Новгород: Прикладное искусство и археология: Альбом / Колчин Б. А., Янин В. Л., Ямщиков С. В. М.: Изобразительное искусство, 1985
Спасённая красота: Рассказы о реставрации памятников искусства: Книга для учащихся старших классов. М.: Просвещение, 1986
Архимандрит Алипий. Человек. Художник. Воин. Игумен. М.: Москва, 2004